在男方入赘且育有三个孩子的离婚案件中，关于孩子抚养权的判定，法院会遵循最有利于未成年子女的原则，并综合考虑多方面因素来做出决定。以下是对这一问题的详细解答：

一、核心结论

抚养权的判定将依据孩子的年龄、双方的抚养能力和条件、孩子与父母的感情亲密程度以及孩子的意愿（若孩子已满八周岁）等因素来综合决定。法院可能判决一方抚养所有孩子，也可能判决双方分别抚养部分孩子，具体需结合实际情况来裁定。

二、详细分析

1. 孩子的年龄：

   • 若孩子不满两周岁，一般随母亲生活，但母亲有不宜抚养情形的除外。
   • 若孩子已满两周岁但未满八周岁，法院会综合考量双方的抚养能力和条件，如经济收入、住房、教育背景等，以及孩子与父母的感情亲密程度，来判断哪方更适合抚养孩子。
   • 若孩子已满八周岁，法院会尊重孩子的真实意愿，并考虑其意见来做出决定。

2. 双方的抚养能力和条件：

   • 法院会评估双方的经济状况、居住条件、教育资源等，看哪方能为孩子提供更稳定、更有利的成长环境。
   • 一方如果存在家暴、吸毒等不良行为，获得抚养权的可能性较小。

3. 孩子与父母的感情亲密程度：

   • 长期与某方生活、感情深厚的一方，在争取抚养权时可能会得到更多的考虑。

4. 特殊情况：

   • 若双方都愿意抚养孩子且条件相当，法院可能会采取轮流抚养的方式，或者依据具体情况做出其他判决。
   • 若一方已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力，或者子女随其生活时间较长、改变环境对子女成长明显不利等情形，法院在判决时可能会给予优先考虑。

三、法律建议

在面临此类离婚案件时，建议双方首先尝试通过协商来解决抚养权问题，以达成对双方和孩子都最有利的解决方案。如果协商不成，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径来争取自己的权益。同时，也要尊重孩子的意愿和感受，确保他们的权益得到充分的保护。

如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我作为专业律师，将竭诚为您提供婚姻家庭、遗产继承等领域的法律咨询和服务。