针对您提出的问题，关于公司公众号挂有版权问题的小程序，但主体不是公司时公司的法律责任，以下是我的详细解答：
首先，结论前置：
公司公众号如果挂有版权问题的小程序，即使该小程序的主体不是公司，公司也可能因涉及侵权行为的帮助、共同侵权或未尽到合理审查义务而承担一定的法律责任。
接下来，详细分析：
帮助侵权：
- 如果公司知道或应当知道其公众号上挂载的小程序存在版权问题，但仍然提供挂载服务，或者未采取必要措施防止侵权行为的发生，那么公司可能被视为帮助侵权者，从而与直接侵权者共同承担侵权责任。
共同侵权：
- 在某些情况下，如果公司与小程序开发者或运营者存在合作关系，且共同参与了侵权行为的实施或推广，那么公司可能被认定为共同侵权者，与小程序开发者或运营者共同承担侵权责任。
未尽到合理审查义务：
- 作为公众号的管理者，公司有义务对其公众号上挂载的内容进行合理审查，以确保其合法性和合规性。如果公司未尽到这一义务，导致侵权内容得以传播，那么公司可能因未尽到合理审查义务而承担一定的法律责任。
法律建议：
为了避免因挂载版权问题的小程序而承担法律责任，公司应当：
- 加强对其公众号上挂载内容的审查和管理，确保所有内容均合法合规；
- 在挂载小程序前，与小程序开发者或运营者明确责任和义务，确保小程序不存在版权问题；
- 一旦发现小程序存在版权问题，立即采取措施予以删除或下架，并积极配合相关部门的调查和处理工作。
综上所述，公司公众号如果挂有版权问题的小程序，即使主体不是公司，公司也可能因涉及侵权行为的帮助、共同侵权或未尽到合理审查义务而承担法律责任。因此，公司应当加强对其公众号上挂载内容的审查和管理，以确保其合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。