当您的店铺被供水公司造成的水淹事件影响时，为了获得合理的赔偿，您需要按照以下步骤进行：

一、明确水淹原因与责任主体

首先，要迅速确定水淹的具体原因。若确认是供水公司的设施故障或操作不当导致的水淹，那么供水公司就应承担相应的赔偿责任。同时，也要考虑是否存在其他责任方，如物业管理方因疏忽导致的排水系统问题。

二、全面且详细地收集证据

1. 现场照片与视频：立即拍摄现场照片或视频，记录水位线、受损情况等，确保能够全面反映水淹的实际情况。
2. 损失清单：详细列出受损物品的名称、数量、价值，并尽可能附上购买发票、维修报价单等证明文件。
3. 官方证明材料：向物业、消防、街道办等相关部门报备，并获取官方的证明材料，以证明水淹事件的真实性和严重性。
4. 通信记录：保留与供水公司、物业等责任方的所有沟通记录，包括电话记录、短信、邮件等，作为后续协商或诉讼的依据。

三、准确计算损失

在计算损失时，除了考虑直接的财产损失（如存货损失、设备设施损坏）外，还应考虑经营损失，包括停业期间的营业收入损失、清洁消毒费用、维修费用以及员工工资、租金等固定成本。

四、向供水公司提交赔偿申请

在收集了充分的证据并准确计算了损失后，您可以向供水公司提交赔偿申请书。申请书中应明确列出赔偿请求、损失清单及证据材料，并尝试与供水公司进行协商，以达成赔偿协议。

五、协商不成，依法维权

如果与供水公司的协商未能达成一致，您可以考虑通过以下途径依法维权：

1. 投诉调解：向相关部门（如水务局、消费者协会等）投诉，请求介入调查和调解。
2. 提起诉讼：若调解无果，您可以聘请律师撰写起诉状，向法院提起民事诉讼，要求供水公司承担赔偿责任。在诉讼过程中，务必充分举证证明损失和供水公司的过错。

六、注意事项

• 及时行动：水淹事件发生后，务必立即采取行动，避免证据丢失或损失进一步扩大。
• 专业咨询：在处理赔偿事宜时，如有需要，可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
• 保留证据：在整个过程中，务必妥善保管所有证据材料，以备不时之需。

综上所述，当您的店铺被供水公司淹没时，通过明确责任主体、全面收集证据、准确计算损失，并采取有效的申请策略，您可以更有力地维护自己的合法权益。