刑事案件登记保存是侦查机关在办案过程中，对于与案件有关的物品、文件等进行记录、封存和保管的一系列程序。以下是详细的步骤及法律依据：

一. 登记保存的主体与权限

1. 主体：根据《刑事诉讼法》的相关规定，公安机关、人民检察院等侦查机关有权进行登记保存。
2. 权限：侦查人员在侦查过程中发现的可用以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的各种财物、文件，应当查封、扣押；与案件无关的财物、文件，不得查封、扣押。对查封、扣押的财物、文件，要妥善保管或者封存，不得使用、调换或者损毁。

二. 登记保存的具体步骤

1. 发现与识别：侦查人员在案件侦查过程中，发现与案件有关的物品、文件等。

   • 例如，在盗窃案中，侦查人员在现场发现了一把疑似作案工具的钳子。

2. 记录与描述：对发现的物品、文件进行详细记录，包括名称、数量、特征、状态等，并制作清单。

   • 法律依据：《刑事诉讼法》第一百四十三条，侦查人员认为需要扣押犯罪嫌疑人的邮件、电报的时候，经公安机关或者人民检察院批准，即可通知邮电机关将有关的邮件、电报检交扣押。不需要继续扣押的时候，应即通知邮电机关。

3. 封存与保管：将物品、文件封存，并采取必要的保管措施，确保其不被损坏、丢失或改变。

   • 例如，将钳子装入证据袋中，并贴上封条，存放在安全的证据保管室。

4. 制作笔录与拍照：对登记保存的过程制作笔录，并视情况对物品、文件进行拍照或录像，以固定证据。

   • 法律依据：《刑事诉讼法》第一百四十一条，在侦查活动中发现的可用以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的各种财物、文件，应当查封、扣押；与案件无关的财物、文件，不得查封、扣押。对查封、扣押的财物、文件，要妥善保管或者封存，不得使用、调换或者损毁。

5. 移交与保管：将登记保存的物品、文件及清单、笔录等一并移交给案件承办部门或专门的保管部门。

   • 例如，将钳子及相关证据材料移交给刑警队的物证保管室。

三. 登记保存的后续处理

1. 审查与处理：案件承办部门应对登记保存的物品、文件进行审查，根据案件需要决定是否作为证据使用。
2. 返还或没收：对于与案件无关或不需要作为证据的物品、文件，应及时返还给相关当事人；对于需要作为证据的物品、文件，则按照法律程序进行没收或处理。

我建议在实际操作中，侦查机关应严格遵守相关法律法规和程序规定，确保登记保存工作的合法性、规范性和有效性。同时，当事人也应积极配合侦查机关的工作，提供必要的协助和信息。如有进一步需要，您可以继续咨询我。