股东是公司法人时，其打入公司账户的钱款可以是投资款。但具体是否构成投资款，需根据款项的实际用途、双方的约定以及公司财务记录等因素来综合判断。
一. 投资款的认定
款项用途：如果股东（法人）打入公司账户的钱款明确用于增加公司注册资本、扩大公司规模或投资特定项目，且这些用途在公司章程、股东会决议或相关协议中有明确记载，那么这笔钱款可以被认定为投资款。
双方约定：股东（法人）与公司之间可以签订投资协议或相关文件，明确款项的性质、用途、金额以及双方的权利义务。如果协议中明确约定该款项为投资款，那么其性质就得以确认。
公司财务记录：公司财务记录也是判断款项性质的重要依据。如果公司财务账簿上将该笔款项记录为投资款，且符合相关会计准则和法规要求，那么也可以认定其为投资款。
二. 法律依据
虽然《公司法》等法律法规并未直接规定股东（法人）打入公司账户的钱款是否构成投资款，但根据《公司法》的相关规定，股东有权对公司进行出资，且出资方式可以是货币、实物、知识产权等方式。因此，股东（法人）以货币方式打入公司账户的钱款，在符合相关法律法规和公司内部规定的前提下，可以被认定为投资款。
三. 注意事项
明确约定：为避免后续纠纷，股东（法人）与公司之间应签订明确的投资协议或相关文件，明确款项的性质、用途、金额以及双方的权利义务。
合规操作：股东（法人）在打入投资款时，应确保款项来源合法、用途明确，并符合相关法律法规和公司内部规定的要求。
财务记录：公司应建立健全的财务记录制度，确保每一笔款项的性质、用途和金额都有明确的记录，以便后续审计和查询。
综上所述，股东是公司法人时，其打入公司账户的钱款在符合相关法律法规和公司内部规定的前提下，可以被认定为投资款。但为确保双方权益，建议签订明确的投资协议或相关文件，并严格遵守相关法律法规和公司内部规定的要求。如有进一步需要，您可以继续咨询我。