取保候审结束后，若案件事实清楚，证据确实、充分，司法机关会根据实际情况作出结案决定，具体分为存在违法事实和无违法事实两种情况处理。以下是详细的办理流程及法律依据：

一. 取保候审后结案的办理流程

1. 调查取证与结案决定：

   • 取保候审结束后，司法机关会继续对案件进行调查取证。
   • 若存在违法事实，司法机关将依法追究法律责任并结案。
   • 若没有违法事实，司法机关将释放被取保候审人并结案处理。

2. 解除取保候审：

   • 取保候审期限届满或者发现不应当追究刑事责任时，司法机关应当及时解除取保候审，并通知被取保候审人及相关单位。
   • 执行机关收到决定机关的《解除取保候审决定书》后，应当立即执行，并将执行情况及时通知决定机关。

3. 保证金退还：

   • 被取保候审人在取保候审期间未违反相关规定，也未被发现有其他犯罪行为的，结案时，司法机关会将保证金退还被取保候审人。

4. 违规处理：

   • 若被取保候审人在取保候审期间违反规定，已交纳保证金的，司法机关将没收部分或者全部保证金，并根据情节轻重，责令被取保候审人具结悔过，重新交纳保证金、提出保证人，或者监视居住、予以逮捕。

二. 法律依据

• 《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十九条：人民法院、人民检察院和公安机关对犯罪嫌疑人、被告人取保候审最长不得超过十二个月，监视居住最长不得超过六个月。在取保候审、监视居住期间，不得中断对案件的侦查、起诉和审理。对于发现不应当追究刑事责任或者取保候审、监视居住期限届满的，应当及时解除取保候审、监视居住。解除取保候审、监视居住，应当及时通知被取保候审、监视居住人和有关单位。

• 《中华人民共和国刑事诉讼法》相关条款（虽未直接提及结案流程，但规定了取保候审的期限、解除条件等，为结案流程提供了法律依据）。

我建议，在取保候审结束后，您应积极配合司法机关的调查取证工作，并关注案件进展。若案件结案且您符合退还保证金条件，应及时向司法机关申请退还保证金。如有进一步需要，您可以继续咨询我。