被拍照的电动自行车违章将处警告或者五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的，可以扣留其非机动车。

一. 法律依据

• 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第八十九条，行人、乘车人、非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的，可以扣留其非机动车。

二. 处理流程

1. 接收通知：通常，当电动自行车违章被拍照后，车主会收到相关的违章通知，包括违章时间、地点、违章行为以及应缴纳的罚款金额等。
2. 确认违章：车主在收到通知后，应仔细核对违章信息，确保无误。
3. 缴纳罚款：如确认违章无误，车主应按规定的时间、地点和方式缴纳罚款。可以选择线上或线下的方式支付。
4. 处理结果：缴纳罚款后，车主应保留好相关凭证，以备后续查询或处理可能出现的问题。

• 例如，张先生骑电动自行车在禁行区域行驶，被电子眼拍照记录。他随后收到了违章通知，并确认了自己的违章行为。张先生按照通知上的要求，及时缴纳了罚款，并保留了缴费凭证。

三. 特殊情况

• 如果车主对违章有异议，可以向相关部门提出申诉，并提供相关证据。相关部门将根据实际情况进行复核，并给出最终处理结果。

我建议车主在收到违章通知后，应积极配合处理，及时缴纳罚款，避免产生不必要的麻烦。同时，也应加强交通安全意识，遵守交通规则，确保自身和他人的安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。