甲方结算运费费用的计算，首先应依据合同中的约定；若合同未约定或约定不明确，则按照订立合同时履行地的市场价格来确定。具体分析如下：

一. 依据合同约定计算

• 甲乙双方在合同中应明确约定运费的计算方式、标准以及支付时间等条款。
• 如合同中有具体约定，则按照约定的方式计算运费。

二. 合同未约定或约定不明确时的处理

1. 协商补充：根据《中华人民共和国民法典》第五百一十条，合同生效后，当事人就运费等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充。
2. 按照交易习惯或市场价格确定：若不能达成补充协议，按照合同相关条款或者交易习惯确定；仍不能确定的，依据《中华人民共和国民法典》第五百一十一条第六款，履行费用的负担不明确的，由履行义务一方负担，即通常由承运方（可能是甲方或乙方，具体看合同约定）按照订立合同时履行地的市场价格来承担运费。

三. 实际操作中的建议

• 在签订合同时，应尽可能明确运费的计算方式、标准以及支付时间等，以避免后续产生争议。
• 如合同未明确约定，双方应及时沟通并协商补充，以确保运费结算的顺利进行。
• 若协商不成，可寻求法律途径解决争议。

综上所述，甲方结算运费费用的计算应首先依据合同中的约定；若合同未约定或约定不明确，则双方应协商补充或按照交易习惯及市场价格来确定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。