被扣留5天通常不会留下案底。这里所说的“案底”，一般指的是犯罪记录，即经过法院审理后被确定犯罪的公民或单位所留下的记录。而扣留，无论是行政拘留还是刑事拘留，通常只是一种强制措施，并不等同于犯罪判决。

1. 行政拘留：行政拘留是一种行政处罚，即使被拘留，也不会留下犯罪记录，但其相关记录会在公安机关长期保存。这些记录主要用于记录该次拘留的事实和情况，对个人的一些资格审查等可能会产生一定影响，比如在入伍、报考公务员等方面可能会受到限制。然而，这并不构成法律意义上的“案底”。

2. 刑事拘留：刑事拘留是刑事诉讼中的一种强制措施。如果最终没有被法院判定有罪，那么就不会留下犯罪记录。在侦查、审查批捕、审查起诉等阶段，如果公安机关或检察机关认为情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的，会撤案或作出不起诉决定，这样也不会留下案底。

综上所述，被扣留5天通常不会留下案底。但需要注意的是，虽然不留下案底，但相关记录仍可能在一定期限内对个人的某些方面产生影响。因此，建议遵守法律法规，避免任何违法行为。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。