赔偿交个税并不一定要有法院判决，有协议也是可以的。具体分析如下：

1. 个税缴纳依据：

   • 个人所得税的缴纳是基于所得的发生，而所得的形式多种多样，包括但不限于工资、薪金、奖金、津贴、补贴、稿酬、特许权使用费等。
   • 在赔偿交易中，如果个人获得了赔偿收入，且该收入属于个人所得税法规定的应税所得范畴，那么就需要依法缴纳个人所得税。

2. 协议与法院判决的效力：

   • 协议是双方自愿达成的约定，只要内容合法、有效，且双方均认可，就可以作为个税缴纳的依据。
   • 法院判决则是有法律效力的文书，对双方当事人具有强制约束力。在涉及赔偿的案件中，法院判决通常会明确赔偿金额和支付方式，这也是个税缴纳的重要依据。

3. 个税缴纳实践：

   • 在实际操作中，无论是依据协议还是法院判决获得的赔偿收入，只要属于应税所得，都需要在取得收入的次年三月一日至六月三十日内，通过汇算清缴的方式向税务机关申报并缴纳个人所得税。
   • 如果赔偿收入较高，可能还需要在取得收入的当月或次月预缴个人所得税。

综上所述，赔偿交个税并不一定要有法院判决，有合法有效的协议也是可以的。在个税缴纳时，应关注所得的性质和金额，以及是否需要预缴或汇算清缴。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。