企业申请注销期间收费是否合法，需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法收费情况：

   • 在企业申请注销的过程中，若涉及的相关行政部门（如工商行政管理部门）按规定收取注销登记费用等，这类费用是基于行政管理的成本等因素确定的，因此是合法的。
   • 若企业委托专业的中介机构或代理公司协助办理注销手续，并签订了明确的委托合同，合同中规定了合理的服务费用，那么这种收费也是合法的。

2. 不合法收费情况：

   • 市场上某些中介机构或代理公司以注销公司为由，收取高额费用，且没有明确的法律依据和合理的收费标准，这种收费行为可能是不合法的。
   • 若在注销过程中，企业被要求支付与注销无直接关联的费用，或费用明显超出合理范围，也可能构成不合法收费。

建议：

• 在企业申请注销期间，应仔细审查所有费用明细，确保每项费用都有明确的法律依据或合同依据。
• 若对某项费用存在疑问，应及时向相关部门或专业机构咨询，以避免不必要的损失。
• 若发现存在违法收费情况，应向相关部门投诉举报，以维护自身合法权益。

总之，企业申请注销期间的收费是否合法，需根据具体情况进行判断。在办理注销手续时，企业应保持警惕，确保所有费用都是合理且合法的。