关于耕地种树的处理和处罚，这确实是一个涉及土地管理和使用规定的重要问题。以下是对此问题的详细解答：

一、耕地种树的基本规定

1. 永久基本农田：

   • 根据《土地管理法》第三十七条和《基本农田保护条例》第十七条，禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼。
   • 非法占用永久基本农田种树的，将依据《土地管理法实施条例》第五十一条进行处罚，包括责令限期改正、罚款（按占用面积处耕地开垦费2倍以上5倍以下）以及可能的进一步法律责任。

2. 一般耕地：

   • 对于一般耕地，政策规定是严格控制种树，确需占用的必须依法依规严格履行审批手续，并落实耕地占补平衡。
   • 未经批准占用一般耕地种树的，也可能面临相应的法律责任，具体依据《粮食安全保障法》等相关法规进行处罚。

二、对耕地种树的处理流程

1. 发现与报告：

   • 村民委员会、农村集体经济组织或相关政府部门在发现违反耕地种植用途管控要求的行为后，应及时向乡镇人民政府或县级人民政府农业农村主管部门报告。

2. 调查与处理：

   • 县级自然资源局会责令种树人限期改正，将树木伐移。
   • 拒不改正的，自然资源部门会根据法律程序进行罚款等措施，以恢复耕地属性。

3. 审批与备案：

   • 如果确需占用耕地种植果树的，必须向乡镇政府提出申请，并由乡镇政府批准后落实耕地“进出平衡”，再报自然资源和规划局备案。

三、特殊情况处理

• 对于原来在承包地上已经种植的树木，根据自然资源部办公厅印发的相关通知，经地方各级自然资源主管部门与林草主管部门共同确认后，在尊重农民意愿的前提下，可以逐步恢复为耕地，且无需办理林地审核审批、采伐等手续。

四、建议与提醒

1. 遵守法规：农民在种植作物时，应严格遵守国家关于土地管理和使用的相关法律法规，确保耕地的合理利用和保护。
2. 咨询申请：在计划改变耕地用途时，务必先向当地政府部门咨询并办理相关审批手续。
3. 风险意识：要充分了解违规种植可能带来的法律风险和经济损失，避免不必要的麻烦。

综上所述，耕地种树是一个涉及多方面规定和流程的问题。农民和相关部门应共同努力，确保耕地的合理保护和利用，以维护国家的粮食安全和生态安全。