新生儿做司法亲子鉴定上户口，取样通常由鉴定机构专业人员进行，并遵循严格的程序。具体分析如下：

一. 取样流程

1. 选择鉴定机构：首先，需要选择一个具有司法鉴定资质的机构进行亲子鉴定。这样的机构通常具有专业的取样人员和设备，能够确保取样的准确性和合法性。
2. 确定取样方式：司法亲子鉴定通常采用的取样方式包括血液、毛发、口腔拭子等。对于新生儿，由于血液取样可能较为困难，因此可能会采用口腔拭子或毛发等较为简便的取样方式。
3. 专业取样：在鉴定机构，专业人员会按照规定的程序进行取样。例如，如果采用口腔拭子取样，专业人员会轻轻擦拭新生儿的口腔黏膜，然后将拭子放入专用的保存容器中。
4. 样本保管与送检：取样完成后，样本会被妥善保管并送至实验室进行检测。整个过程中，样本的保管和送检都遵循严格的规定，以确保样本的真实性和完整性。

二. 注意事项

• 取样过程应确保新生儿的安全和舒适，避免对其造成不必要的伤害或不适。
• 取样时，应确保取样人员的专业性和合法性，避免非专业人员或非法机构进行取样。
• 取样完成后，应妥善保管样本，并按照规定的程序送至实验室进行检测，以确保鉴定结果的准确性和合法性。

我建议，在选择鉴定机构和进行取样时，务必遵循相关规定和程序，确保亲子鉴定的合法性和准确性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。