通过民间借贷获取大额回报的违纪所得，应按照相关法律法规和纪律处分条例进行收缴。以下是具体的收缴方式和相关法律依据：

一. 收缴违纪所得的依据

根据《中国共产党纪律处分条例》第九十九条第二款的规定，通过民间借贷等金融活动获取大额回报，可能影响公正执行公务的，情节较重的给予警告或者严重警告处分；情节严重的给予撤销党内职务、留党察看或者开除党籍处分。对于违纪行为所获得的经济利益，应当收缴或者责令退赔。

二. 收缴违纪所得的方式

1. 直接收缴：

   • 当违纪所得以现金或其他可直接变现的形式存在时，应直接收缴。

2. 责令退赔：

   • 若违纪所得已用于其他用途或无法直接收缴，应责令违纪人员退赔相应金额。

3. 利息及增值部分的处理：

   • 若违纪所得在持有期间产生了利息或其他增值，这些增值部分也应一并收缴或责令退赔。

三. 收缴违纪所得的具体操作

1. 调查核实：

   • 首先，需要对民间借贷行为及其获取的大额回报进行调查核实，确保事实清楚、证据确凿。

2. 发出收缴通知：

   • 在调查核实后，应向违纪人员发出收缴违纪所得的通知，明确收缴的金额、期限和方式。

3. 执行收缴：

   • 违纪人员应在规定期限内将违纪所得上缴至指定账户。若逾期未缴，可采取进一步的法律措施进行追缴。

四. 注意事项

1. 区分违纪与违法：

   • 在收缴违纪所得时，应明确区分违纪行为与违法行为。对于涉嫌犯罪的，应依法移送司法机关处理。

2. 保护合法权益：

   • 在收缴违纪所得的过程中，应依法保护违纪人员的合法权益，确保其申诉和辩解的权利得到充分保障。

我的观点：通过民间借贷获取大额回报的违纪行为严重违反了廉洁纪律和职业道德，必须依法依规进行严肃处理。在收缴违纪所得时，应严格按照相关法律法规和纪律处分条例的规定执行，确保公正、公平、公开。如有进一步需要，您可以继续咨询我。