电动摩托车的交强险在赔偿时确实不分责任比例。当发生交通事故时，交强险会首先在责任限额内赔偿对方的损失。对于有责的情况，财产损失赔偿限额为2000元。这意味着，无论事故责任在谁，只要是有责方，其交强险都会先行赔付2000元的财产损失。

然而，如果事故损失超出了交强险的赔偿限额，那么超出的部分就需要按照事故责任比例来分担。通常，主要责任方会承担70%的责任，而次要责任方则承担30%的责任。赔偿项目包括但不限于医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金（若造成伤残）、死亡赔偿金（若导致死亡）以及财产损失等。

具体的赔偿计算方式为：（对方总损失 - 交强险赔偿金额）× 责任比例。例如，如果电动三轮车的损失为1万元，汽车交强险赔偿了2000元后，剩余的8000元就需要按照事故责任比例来分担。如果汽车是主要责任方，那么它需要承担8000元的70%，即5600元。

最后，双方可以先尝试协商赔偿事宜。如果协商不成，可以通过交警调解或者向法院起诉来解决赔偿问题。希望这个解答能够帮助您更好地理解电动摩托车的交强险赔偿机制。