公司董事长和法定代表人是两个人时，一般由法定代表人签字付款，因为其具有代表公司从事民事活动的法定权利。具体分析如下：

一. 法定代表人的签字权利

1. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第六十一条，依照法律或者法人章程的规定，代表法人从事民事活动的负责人，为法人的法定代表人。法定代表人以法人名义从事的民事活动，其法律后果由法人承受。这意味着法定代表人有权代表公司进行签字付款等民事活动。
2. 实际应用：在公司的日常运营中，涉及合同签署、款项支付等重要事务时，通常由法定代表人代表公司进行签字，以确保法律效力的有效性。

二. 董事长的角色与权限

1. 职位定义：董事长是公司董事会的主席，负责召集和主持董事会会议，并代表董事会向股东大会报告工作。虽然董事长在公司中具有重要地位，但其并不一定是公司的法定代表人。
2. 签字权限：如果董事长同时被任命为公司的法定代表人，则他/她也有权代表公司进行签字付款。但如果董事长并非法定代表人，则在没有特别授权的情况下，其签字可能不具有代表公司的法律效力。

三. 签字付款的实际操作

1. 明确身份：在确定由谁签字付款时，首先应明确谁是公司的法定代表人。如果法定代表人与董事长是同一人，则由其签字即可。如果不是同一人，则应确保由法定代表人签字。
2. 特别授权：在某些特殊情况下，如果董事长需要代表公司进行签字付款，可以通过公司章程、股东会决议或董事会决议等方式进行特别授权。

综上所述，当公司董事长和法定代表人是两个人时，一般由法定代表人签字付款。这是因为法定代表人具有代表公司从事民事活动的法定权利，其签字行为具有法律效力。如果董事长需要代表公司进行签字付款，应确保获得相应的特别授权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。