拒不配合反恐行政案件对个人可能会有案底。以下是对此问题的详细分析：

一. 拒不配合反恐行政案件的法律后果

根据《中华人民共和国反恐怖主义法》第九十一条的规定，个人或单位拒不配合有关部门开展反恐怖主义安全防范、情报信息、调查、应对处置工作的，将会面临一定的法律后果。

1. 行政处罚：

   • 对于个人而言，如无正当理由拒不配合相关部门的反恐怖主义工作，将会被主管部门处以二千元以下的罚款。
   • 若该行为造成严重后果，个人将会面临五日以上十五日以下的拘留，并可能被并处一万元以下的罚款。

2. 刑事责任：

   • 在更为严重的情况下，拒绝配合反恐工作可能构成刑事犯罪。例如，明知他人有恐怖主义犯罪行为，在司法机关向其调查有关情况、收集有关证据时拒绝提供，且情节严重的，可能会被处以三年以下有期徒刑、拘役或者管制。

二. 案底的形成

• 案底通常是指个人在违法或犯罪后被司法机关处理所留下的记录。这些记录可能包括行政处罚决定书、刑事判决书等，并可能被保存在相关部门的档案中。
• 对于拒不配合反恐行政案件的个人而言，如果其行为构成了行政违法或犯罪，并被公安机关或司法机关依法处理，那么这一处理结果很可能会形成案底，并可能对个人的未来产生一定影响，如影响就业、信用评价等。

三. 我的建议

• 积极配合反恐工作：作为公民，我们有义务配合国家机关开展反恐怖主义工作，共同维护国家安全和社会稳定。
• 了解法律后果：在面临类似情况时，应充分了解可能面临的法律后果，并做出明智的选择。
• 如有需要，寻求法律帮助：如果个人因拒不配合反恐工作而面临法律处罚，建议及时寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。

综上所述，拒不配合反恐行政案件对个人可能会有案底，具体取决于行为的性质和后果。因此，我强烈建议公民在面临类似情况时，务必积极配合国家机关的工作，避免不必要的法律风险。