关于有货代开增值税发票的刑罚处理问题，这主要涉及到税收法律法规以及相关的刑事处罚规定。以下是对此问题的详细解答：
一、合法代开与违法代开的界定
合法代开：
- 个人或企业在符合税收法律法规的前提下，可以代开增值税发票。这通常发生在个人发生应税行为时，应前往税务机关或其委托的代征单位申请代开发票，并如实提交相关资料、缴纳相应税款。
- 合法代开是受法律保护的行为，不会受到刑事处罚。
违法代开：
- 违法代开主要指的是虚开发票的行为，即开具与实际经营业务情况不符的发票。
- 虚开发票可能触犯《中华人民共和国刑法》的相关规定，构成犯罪。
二、违法代开增值税发票的刑事处罚
虚开发票罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条之一，虚开除增值税专用发票以外的其他发票（如增值税普通发票），若情节严重，将面临二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金。
- 情节特别严重的，将受到二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金的处罚。
- 对于单位犯罪，还会对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法进行处罚。
与其他犯罪的牵连情况：
- 如果通过虚开增值税发票来逃税或骗取出口退税，可能会按照牵连犯的原则从一重罪处罚。
- 逃税罪和骗取出口退税罪都有相应的刑事处罚规定，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
三、税务行政处罚及其他法律后果
税务行政处罚：
- 对于不涉及偷逃税款或骗取出口退税等严重违法行为的代开增值税发票行为，如果违反了税收管理法规，可能会受到税务部门的行政处罚，包括罚款、没收违法所得等。
其他法律后果：
- 涉案企业可能会面临停业整顿、吊销税务登记证等后果。
- 税务机关将追缴企业通过虚开发票所骗取的税款和相应的滞纳金。
- 企业的违法行为将被记录在企业信用档案中，影响其商业信誉和银行信贷。
四、实际案例与防范措施
实际案例：
- 某国际货代公司通过虚构运输业务，虚开增值税普通发票，涉及金额巨大。税务机关查实后，企业负责人被判处有期徒刑，并处罚金。公司也被罚款，并责令停业整顿。
防范措施：
- 企业应建立健全发票管理制度，加强对发票开具、取得和使用的监督和控制。
- 加强对员工的培训，提高法律意识，防止违法行为的发生。
- 定期开展内部审计和自查，发现问题及时整改。
- 建立完善的合规管理体系，确保各项经营活动符合国家法律法规的要求。
综上所述，有货代开增值税发票的刑罚处理是一个严肃的问题，涉及到多个法律法规和刑事处罚规定。因此，个人和企业在进行代开增值税发票时，必须严格遵守相关法律法规，确保所有手续齐全、合规，以避免触犯刑法和承担不必要的法律责任。