在电动自行车和汽车发生交通事故40天后才报警的情况下，如果汽车司机不配合后期治疗，受害者可以通过以下途径来维护自己的权益：

1. 寻求交警部门帮助：

   • 尽管事故发生后40天才报警，但受害者仍应尽快向交警部门报案，并提供尽可能详细的事故信息，包括事故发生的时间、地点、双方车辆信息、目击者证言等。
   • 交警部门会根据提供的信息进行调查，并可能出具事故责任认定书，这是后续维权的重要依据。

2. 通过法律途径维权：

   • 如果汽车司机不配合后期治疗，受害者可以依据事故责任认定书，向法院提起民事诉讼，要求司机承担相应的赔偿责任。
   • 在诉讼过程中，受害者需要提供充分的证据证明自己的损失，包括医疗费用、误工费、护理费等，以及因事故导致的其他合理支出。

3. 申请强制执行：

   • 如果法院判决司机承担赔偿责任，但司机仍不配合执行，受害者可以向法院申请强制执行，通过法律手段强制司机履行赔偿义务。

4. 寻求调解或和解：

   • 在法律程序之外，受害者也可以尝试与司机进行调解或和解，通过协商达成赔偿协议，以避免长时间的法律纠纷。

5. 注意保留证据：

   • 在整个过程中，受害者应特别注意保留所有与事故和伤害相关的证据，包括医疗记录、费用清单、事故现场照片、交警部门出具的相关文件等。
   • 这些证据在后续的法律程序中将起到至关重要的作用。

综上所述，尽管事故发生后报警时间较晚，但受害者仍有多种途径来维护自己的权益。建议受害者尽快采取行动，咨询专业律师以获取更具体的法律建议和支持。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。