公司能否因员工上班迟到2-3分钟扣钱，需依据公司合法有效的规章制度，并确保扣钱行为合理公正。

1. 法律依据与扣钱行为：

   • 我国法律未明确赋予用人单位罚款权，罚款属行政处罚，仅由行政机关实施。因此，公司直接罚款不合法。

2. 规章制度的有效性分析：

   • 合法制定：公司规章制度需按法定程序制定，如经职工代表大会讨论、与工会协商确定，并向劳动者公示。只有合法制定的规章制度才具有法律效力。
   • 内容合理性：规章制度应明确规定迟到处理措施，包括迟到2-3分钟的扣钱标准。此标准需合理、公正，不得损害劳动者权益。
   • 规章制度约束力：合法有效的规章制度对员工有约束力。若规章制度不合法或不合理，公司扣钱行为将不合法。

3. 员工应对建议：

   • 了解规定：员工应查阅员工手册或咨询人事部门，了解公司关于迟到的具体规定。
   • 沟通协商：如认为扣钱不合理，应与公司沟通，要求说明扣钱依据和理由。
   • 法律维权：协商不成时，可向劳动监察部门投诉，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

我的观点：公司可以依据合法有效的规章制度对员工迟到行为进行相应管理，但扣钱行为必须合理公正。员工也应了解自己的权益，必要时采取适当措施维权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。