因质量问题与淘宝商家协商一致后仅退款的订单不违法。具体分析如下：

一. 合同约定与协商一致的效力

1. 协商一致的效力：在合同关系中，如果双方当事人就某一事项（如退款方式）进行了协商并达成一致，该协议即具有法律效力，双方均应遵守。
2. 本案情况：您与淘宝商家因质量问题协商一致后选择了仅退款的方式处理订单，这是双方自愿达成的协议，因此不违法。

二. 法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》的相关规定：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以通过协商的方式变更或解除合同。在本案中，您与商家通过协商一致的方式变更了原合同的履行方式（由退货退款变更为仅退款），这符合民法典的精神。
2. 《中华人民共和国消费者权益保护法》的保障：虽然《中华人民共和国消费者权益保护法》规定了商品不符合质量要求时的退货、更换、修理等义务，但同时也允许消费者与经营者进行协商，以达成双方都能接受的解决方案。因此，您与商家的协商一致行为并不违反该法的规定。

三. 结论 综上所述，因质量问题与淘宝商家协商一致后仅退款的订单不违法。这是基于双方自愿达成的协议，且符合相关法律法规的规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。