父亲有案底一般不会影响女儿入团。下面我将对此进行详细分析：

一. 入团条件与政审要求

1. 入团条件：根据中国共产主义青年团的组织原则，入团主要考察的是个人的政治觉悟、思想品德、学习成绩等方面，并未明确规定家庭成员的犯罪记录会影响入团。
2. 政审要求：虽然某些特定情况下，如涉及国家安全、敏感岗位等，可能会进行更为严格的政审，包括考察家庭成员的情况，但普通的入团程序并不涉及此类政审。

二. 法律与政策依据

• 根据我国相关法律和政策，个人的政治权利和社会地位不应因其家庭成员的犯罪记录而受到不公正的影响。入团作为青年人的一项政治权利，同样应遵循这一原则。

三. 实际情况分析

• 在实际操作中，学校或团组织在审核入团申请时，主要关注的是申请人本人的表现，如学习成绩、道德品质、参与社会活动等，而很少会涉及其家庭成员的背景。

综上所述，父亲有案底通常不会影响女儿的入团申请。如有进一步需要，您可以继续咨询我。