携程扣商户的违约金应根据双方合同中的约定来计算。具体分析如下：

一. 违约金的计算依据

1. 依据合同约定：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。因此，携程扣商户的违约金，首先应依据双方签订的合同中的相关条款来确定。

二. 违约金的调整

1. 过低调整：如果合同中约定的违约金低于因违约给携程造成的实际损失，携程有权根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，请求人民法院或者仲裁机构予以增加。
2. 过高调整：同样，如果合同中约定的违约金过分高于因违约给商户造成的实际损失，商户也有权请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。

三. 违约金的支付与债务履行

1. 支付违约金：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，如果商户违约，且合同中约定了违约金，那么商户需要按照约定支付违约金。
2. 继续履行债务：支付违约金后，如果合同仍然可以继续履行，商户还需要继续履行其合同义务。

我建议，在面临携程扣违约金的情况时，商户应首先查看合同条款，了解违约金的计算方法和数额。如果认为违约金过高或过低，可以依法向人民法院或仲裁机构提出调整请求。同时，如果合同仍然可以继续履行，商户应继续履行其合同义务，以避免进一步的违约责任。如有进一步需要，您可以继续咨询我。