合同档案补充协议算一份合同。补充协议是双方当事人根据实际情况而对未约定或约定不明的地方重新协商签订的一种协议，它是对原合同内容的补充，并与原合同共同构成一个完整的合同体系。以下是对这一结论的详细解释：

1. 法律性质：

   • 补充协议依附于原合同而存在，但其本身具有相对独立性，它自身有明确的约定内容和法律效力，在约定的范围内对双方当事人具有约束力。
   • 补充协议与原合同构成主从关系，原合同作为主合同可以独立存在和发挥效力，而补充协议则必须以原合同的存在为基础。

2. 法律效力：

   • 在符合法律规定的合同成立要件和生效要件的前提下，补充协议具有与原合同相同的法律效力。
   • 若补充协议与原合同约定不一致，一般以补充协议为准，但此原则并非绝对。若补充协议违反法律法规的强制性规定，或损害国家、集体或第三人利益，则可能被认定为无效。

3. 签订形式与注意事项：

   • 为避免日后纠纷，建议补充协议采用书面形式，并明确约定补充的内容、生效条件等重要条款。
   • 补充协议的内容必须合法、真实、公平，不得违反法律法规的强制性规定。
   • 补充协议的签订应基于双方当事人的真实意思表示和协商一致。

综上所述，合同档案补充协议作为对原合同内容的补充、变更或完善，确实构成合同的一种形式，并与原合同具有同等的法律效力。在实际操作中，双方当事人应充分认识到补充协议的重要性，并在必要时及时签订补充协议以完善合同条款。如有任何关于合同纠纷的问题，您可以随时向我咨询。