投标保函的受益人通常不是招标代理机构，而是招标人（即发包方）。以下是详细分析：

一. 投标保函的受益人分析

1. 投标保函的定义与目的：投标保函是投标人（即承包方或供应商）向招标人提供的一种保证，旨在保证投标人在中标后能够按照招标文件的要求签订合同并履行相关义务。若投标人未能履行这些义务，招标人有权根据投标保函获得相应的赔偿。
2. 受益人的确定：根据投标保函的定义和目的，可以明确受益人是招标人，因为招标人是需要投标人履行义务并可能因投标人违约而遭受损失的一方。招标代理机构只是受招标人委托，负责招标活动的组织和实施，并不直接承担因投标人违约而产生的损失。
3. 法律依据：虽然《中华人民共和国招标投标法》中并未直接规定投标保函的受益人，但从该法的相关规定可以推断出，投标保函是为了保障招标人的利益而设立的。例如，该法规定了投标人应当按照招标文件的要求编制投标文件，并对招标文件提出的实质性要求和条件作出响应，这体现了对招标人利益的保护。

二. 招标代理机构与受益人的关系

1. 招标代理机构的角色：招标代理机构是受招标人委托，负责招标活动的组织和实施的机构。它的主要职责是帮助招标人编制招标文件、发布招标公告、组织开标、评标等工作，确保招标活动的公平、公正和透明。
2. 与受益人的区别：虽然招标代理机构在招标活动中扮演着重要角色，但它并不直接参与投标人与招标人之间的合同关系，也不是投标保函的受益人。招标代理机构只是作为招标人的代理人，协助招标人完成招标活动。

综上所述，投标保函的受益人通常是招标人，而不是招标代理机构。这是因为投标保函的目的是为了保障招标人的利益，确保投标人在中标后能够按照招标文件的要求履行合同义务。如有进一步需要，您可以继续咨询我。