公司规定年假跨年过期作废是不合法的。以下是对此结论的详细解释：

1. 法律依据：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第二条，职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假，单位应当保证职工享受年休假。这是劳动者的法定权利，任何单位不得随意剥夺。
   • 根据《职工带薪年休假条例》第五条及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，年休假可在1个年度内集中或分段安排，一般不跨年度。但单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。若单位因工作需要不能安排职工休年休假，必须征得职工本人同意，并对未休年休假天数按日工资收入的300%支付报酬。

2. 公司规定的合法性分析：

   • 公司规定年假跨年过期作废，实质上是限制了劳动者的年休假权利，与上述法律法规相悖。
   • 年休假是劳动者的合法权益，单位应依法保障，而非通过内部规定进行剥夺或限制。

3. 特殊情况处理：

   • 只有在特定条件下，如员工因个人原因书面提出不休年休假，且公司已按照正常出勤支付了工资报酬的情况下，公司才可以不支付未休年休假的额外报酬。但这并不意味着年假可以过期作废。

4. 法律建议：

   • 如果公司存在年假跨年过期作废的规定，员工有权向公司提出质疑，并要求公司依法安排年休假或支付未休年休假的报酬。
   • 若公司拒绝改正，员工可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等途径来维护自己的合法权益。

综上所述，公司规定年假跨年过期作废是不合法的，员工应了解自己的年休假权利，并在必要时采取法律手段维护自己的合法利益。