《道路交通安全违法行为记分管理办法》是由公安部修订的。具体分析如下：

一. 记分管理办法的修订主体

1. 依据相关法律法规：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，公安机关交通管理部门负责道路交通安全管理工作，包括对道路交通安全违法行为的记分管理。而公安部作为全国公安机关交通管理部门的最高主管机关，负责制定相应的管理办法和规定。
2. 实际修订情况：在实际操作中，《道路交通安全违法行为记分管理办法》的修订工作也是由公安部负责的。公安部会根据道路交通安全管理的实际需要，以及道路交通安全法律、法规的变化，适时对记分管理办法进行修订和完善。

综上所述，《道路交通安全违法行为记分管理办法》是由公安部修订的。这一管理办法的制定和修订，旨在加强道路交通安全管理，规范机动车驾驶人的驾驶行为，提高道路交通安全水平。如有进一步需要，您可以继续咨询我。