因疫情导致的窝工损失，应按照北京市住房和城乡建设委员会印发的相关指导意见进行计算和协商处理。具体分析如下：
一. 窝工损失的计算
- 窝工降效期间的确定：根据北京市住房和城乡建设委员会的指导意见，受疫情防控应急措施影响期间工程未停工或者开复工的，实际施工期间为窝工降效期间。这意味着，如果工程在疫情期间没有停工，或者虽然停工但后来又复工了，那么这段期间的施工就可以视为窝工降效期间。
- 窝工降效费用的计算：窝工降效费用由发承包双方根据实际情况协商确定。如果协商不能达成一致，那么根据工程所处的封控区、管控区或防范区，人工和施工机械消耗量将分别调增一定比例，如封控区调增30%～40%，管控区调增15%～35%，防范区调增10%～20%。这些增加的费用应计入工程造价，并据实调整合同价款。
二. 窝工损失的处理
- 协商与签证：发承包双方应首先通过协商确定窝工降效的具体天数和费用。协商一致的，应以签证方式共同确认，并列入当期工程进度款同期足额支付。
- 参考指导意见：如果协商不能达成一致，双方应参照北京市住房和城乡建设委员会的指导意见进行处理。这包括根据工程所处的防控区域和受影响程度，按照指定的比例调整人工和施工机械的消耗量。
三. 实际应用
- 例如，如果某个工程在疫情期间处于管控区，且实际施工期间发生了窝工降效，那么发承包双方可以根据指导意见，协商确定窝工降效的具体天数和费用。如果协商不成，就可以按照管控区的标准，即人工和施工机械消耗量分别调增15%～35%，来计算窝工降效费用。
我建议，在处理因疫情导致的窝工损失时，发承包双方应充分沟通、协商，并参照相关指导意见进行合理计算和处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。