母亲不同意做亲子鉴定，如果并非处于诉讼程序中或并未被法院强制要求，则是合法的。下面我对此进行详细分析：
一. 亲子鉴定的合法性
亲子鉴定的定义：亲子鉴定是运用生物学、遗传学以及有关学科的理论和技术，根据遗传性状在子代和亲代之间的遗传规律，判断被控的父母和子女之间是否存在亲生关系的鉴定。
非诉讼情况下的自愿性：在大多数情况下，亲子鉴定是基于自愿原则的，即父母和子女双方自愿进行鉴定。如果母亲不同意做亲子鉴定，且并非处于诉讼程序中或没有法律强制要求，那么她有权拒绝，这是合法的。
二. 诉讼程序中的亲子鉴定
诉讼中的强制鉴定：在某些特定的诉讼程序中，如离婚诉讼、继承诉讼等，亲子关系的确认可能对案件的审理结果产生重大影响。此时，如果一方申请进行亲子鉴定，且法院认为有必要进行鉴定，那么可能会强制要求进行亲子鉴定。
不同意鉴定的后果：如果母亲在诉讼程序中不同意进行亲子鉴定，且法院认为鉴定对案件审理有关键作用，那么母亲的不配合可能会影响法院对案件的判决。在某些情况下，法院可能会根据已有证据和法律规定，对不同意鉴定的一方做出不利推断。
三. 总结
综上所述，母亲不同意做亲子鉴定，在大多数情况下是合法的，特别是当并非处于诉讼程序中或没有法律强制要求时。然而，在诉讼程序中，如果法院认为亲子鉴定对案件审理有关键作用，可能会强制要求进行鉴定。此时，如果母亲仍然不同意，可能会面临不利的法律后果。我建议，在具体情况下，应根据实际情况和法律规定来判断亲子鉴定的合法性和必要性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。