非法改装车顶，将可能面临罚款、责令恢复原状、收缴非法装置等处罚，并有可能因改装导致的其他违规行为而被扣分。具体分析如下：

一. 处罚措施

1. 罚款：根据相关法律法规，私自改变机动车外形和已登记的有关技术数据，如改装车顶，公安机关交通管理部门将责令恢复原状，并处警告或者五百元以下罚款。若改变了已登记在案的车辆结构、构造或特征，且情节较为严重，罚款金额可能为500元以上2000元以下。

2. 责令恢复原状与收缴非法装置：对于改装车顶的行为，公安机关交通管理部门将要求车主恢复车辆原状，并收缴非法加装的装置，即改装后的车顶部分。

3. 扣留车辆：在某些情况下，如改装行为严重或车主未在规定时间内恢复原状，公安机关交通管理部门有权扣留车辆。

4. 刑事责任：若改装后的车辆用于进行飙车等危害公共安全的活动，除行政处罚外，还可能触犯《中华人民共和国刑法》，构成危险驾驶罪，面临拘役及罚金等刑事处罚。但此情况并非仅因改装车顶导致，而是与改装后的使用行为有关。

二. 扣分情况

• 非法改装车顶本身并不直接导致扣分。但如果因改装导致车辆违反其他交通规则，如超速、闯红灯等，则会根据相应违规行为进行扣分。

三. 总结与建议

• 非法改装车顶是违反交通法规的行为，不仅可能面临处罚，还可能带来安全隐患。
• 我建议车主严格遵守相关法律法规，不进行任何形式的非法改装。对于已存在的非法改装行为，应尽快主动恢复原状，以避免可能的法律后果。
• 如有进一步需要，您可以继续咨询我，了解具体的法律条款和处罚措施。