责任主体灭失矿坑的认定标准主要依据的是相关的政策文件以及具体的核查工作方案。具体如下：

一. 政策文件依据

1. 自然资源部办公厅文件：根据《自然资源部办公厅关于开展全国历史遗留矿山核查工作的通知》(自然资源办函〔2021〕1283号)，该文件对全国历史遗留矿山的核查工作提出了明确的要求和指导，是责任主体灭失矿坑认定的重要政策依据。

2. 地方具体实施方案：如云南省自然资源厅印发的《云南省历史遗留矿山核查工作方案》(云自然资修复〔2021〕645号)，该方案结合云南省的实际情况，对历史遗留矿山的核查工作进行了具体的部署和安排，包括责任主体灭失矿坑的认定标准和程序等。

二. 认定标准

虽然具体的认定标准可能因地区而异，但通常都会包括以下几个方面：

1. 责任主体情况：核查矿山的历史责任主体是否已经灭失，即无法找到或无法确定具体的责任人或责任单位。

2. 矿山现状：对矿山的现状进行核查，包括矿山的生态环境状况、是否存在安全隐患等，以确定是否需要进行生态修复或治理。

3. 政策符合性：核查矿山是否符合国家及地方关于历史遗留矿山的相关政策要求，如是否属于历史遗留问题、是否纳入相关治理计划等。

三. 实例说明

• 例如，在云南省，根据《云南省历史遗留矿山核查工作方案》，对于责任主体灭失的矿山，会经过一系列的核查程序，包括资料收集、现场踏勘、专家论证等，最终根据核查结果认定为历史遗留矿山，并确定生态修复责任主体为地方政府。

综上所述，责任主体灭失矿坑的认定标准是一个综合性的判断过程，需要依据相关政策文件、核查工作方案以及具体的核查程序来确定。如果您对具体的认定标准或程序有疑问，建议咨询当地自然资源部门或相关专家。如有进一步需要，您可以继续咨询我。