机动车驾驶人记分未满12分但有罚款，应及时缴纳罚款。具体处理流程如下：

1. 确认罚款信息：首先，驾驶人应查询并确认自己的罚款信息，包括罚款金额、罚款原因及缴纳期限等。可以通过交通管理部门的官方网站、APP或前往交警部门进行查询。

2. 及时缴纳罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶人应依法接受处理，不得拖延。应在规定的期限内，通过银行、网上支付平台或交警部门指定的其他方式缴纳罚款。若逾期未缴纳，可能会产生滞纳金，甚至影响驾驶人的信用记录。

3. 记分处理：虽然记分未满12分，但罚款的缴纳与记分周期有关。若在一个记分周期内记分虽未达到12分，但尚有罚款未缴纳的，记分将转入下一记分周期。因此，及时缴纳罚款对于保持驾驶证的良好记录至关重要。

• 例如，驾驶人因违规停车被罚款200元，并记3分。虽然记分未满12分，但驾驶人仍需在规定期限内缴纳罚款，否则该记分将转入下一记分周期，并可能影响驾驶人的信用记录。

综上所述，机动车驾驶人记分未满12分但有罚款时，应及时查询并确认罚款信息，然后在规定期限内缴纳罚款，以确保驾驶证的良好记录和避免不必要的法律后果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。