如果招商银行信用卡逾期，而公司工资发放至招商银行卡，银行有可能会根据逾期情况和相关协议进行扣款。以下是对此问题的详细分析：

一. 银行扣款的可能性

1. 逾期与扣款的关系：根据信用卡使用协议，若持卡人逾期未还款，银行有权采取多种催收措施，包括但不限于从持卡人在该银行的其他账户中扣款以偿还逾期款项。因此，如果工资发放至招商银行卡，且信用卡存在逾期，银行理论上是可以进行扣款的。
2. 扣款的具体操作：银行在扣款前，通常会按照协议约定的方式通知持卡人，如通过短信、电话、邮件等。扣款金额可能包括逾期本金、利息、滞纳金等费用。若持卡人账户余额不足，银行可能会部分扣款或持续尝试扣款。

二. 持卡人的权益与应对

1. 了解逾期情况：持卡人应首先了解自己的信用卡逾期情况，包括逾期金额、逾期时间、利息和滞纳金等。这有助于判断银行是否可能进行扣款，以及扣款的大致金额。
2. 与银行沟通：如果担心工资被扣款，持卡人可以主动与银行联系，说明自己的还款意愿和实际情况，寻求解决方案。银行可能会提供分期还款、延期还款等选项。
3. 保障生活费用：如果工资被扣款，持卡人应确保有足够的生活费用。可以考虑提前预留一部分资金在其他银行账户或支付平台中，以备不时之需。

三. 法律层面的考虑

1. 合同法的应用：信用卡使用协议是持卡人与银行之间的合同。根据《合同法》的相关规定，双方应履行合同约定的义务。因此，如果协议中明确规定了逾期还款的扣款条款，银行是有权按照约定进行扣款的。
2. 持卡人的救济途径：如果认为银行的扣款行为存在不当或违法之处，持卡人可以通过法律途径维护自己的权益。例如，可以向银行提出异议，要求解释扣款依据；也可以向相关监管部门投诉；甚至可以通过诉讼方式解决争议。

我建议：如果招商银行信用卡已经逾期，且公司工资发放至招商银行卡，应尽快与银行联系并了解相关情况。同时，确保有足够的生活费用储备，并考虑与银行协商制定合适的还款计划。如有进一步需要，您可以继续咨询我。