经济补偿金是按照应发工资计算的。下面我将从法律依据、计算方式以及特殊情况处理等方面进行详细解释：

法律依据

根据《劳动合同法实施条例》第二十七条规定，劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。这一规定明确了经济补偿金的计算基准是应发工资，而非实发工资。

计算方式

1. 应发工资的构成：应发工资是指劳动者在提供正常劳动的情况下，用人单位应当支付给劳动者的工资报酬总额，包含基本工资、奖金、津贴、补贴等。
2. 具体计算：经济补偿金按照劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资计算。这里的工资是指劳动者的应发工资，若劳动者的月平均工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。若劳动者月工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算经济补偿金。

特殊情况处理

1. 工作不满12个月：对于工作不满12个月的劳动者，按照实际工作月数计算平均工资。
2. 加班工资：加班工资是否计入经济补偿金的计算基数，需结合劳动合同中的相关条款及所在地的法律法规与政策规范进行考虑。若劳动合同或当地法规有明确规定加班工资不纳入经济补偿金计算范围的，则不计入。

综上所述，经济补偿金是按照应发工资计算的，这一规定旨在全面反映劳动者的劳动报酬水平，保障劳动者在解除或终止劳动合同时获得公平合理的经济补偿。如有任何疑问或需要进一步了解相关法律问题，请直接向我咨询。