迟到扣工资是否违法，主要取决于用人单位的规章制度是否合法、合规，以及扣减工资的行为是否合理。以下是对此问题的详细分析：

1. 规章制度需合法制定并公示：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，必须经过职工代表大会或全体职工的讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。同时，这些规章制度还必须向劳动者进行公示或告知。
   • 如果用人单位的规章制度未经上述民主程序制定，或者未向劳动者公示，那么基于这样的规章制度扣减员工工资将是违法的。

2. 扣工资数额需合理：

   • 即便用人单位有了合法的规章制度，扣减工资的行为也必须在合理的范围内进行。
   • 根据相关规定，因劳动者个人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可以要求其赔偿，但扣除的工资部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
   • 对于仅仅是迟到而未给单位造成实际经济损失的情况，如果扣除了较大比例的工资（如当天甚至几天的工资），这显然是不合理的，也属于违法行为。

3. 合法合规的规章制度下扣工资是合法的：

   • 如果用人单位的规章制度是经过合法程序制定，内容合法且不违反公序良俗，并已向劳动者进行了公示或告知，同时关于迟到扣工资的规定也是合理的（如规定迟到一次扣除适当金额，且不会对劳动者的基本生活造成严重影响），那么在这种情况下，用人单位根据规章制度对迟到员工扣减工资就是合法的。

4. 特殊情形：

   • 需要注意的是，有些特殊情形下扣工资是违法的，如上班迟到扣半天或一天工资、请假扣2倍或3倍工资等，这些都不符合法律规定。

综上所述，迟到扣工资是否违法并不能一概而论，而是需要综合考虑用人单位的规章制度是否合法、合规，以及扣减工资的行为是否合理。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。