针对您提出的问题，即原告声称通过短信通知了被告但被告表示未收到的情况，被告可以通过以下方式来证明自己确实未收到通知，并维护自己的合法权益：

一、核查通讯记录

首先，被告可以检查自己的手机通讯记录，包括短信收件箱、垃圾短信箱以及是否有来自原告的未接来电或短信通知。如果确实没有相关记录，这可以作为初步证据来证明被告未收到短信。

二、要求原告提供发送证明

被告可以要求原告提供短信发送的详细记录，包括发送时间、发送的短信内容以及发送成功的凭证。根据最高人民法院《关于进一步加强民事送达工作的若干意见》的规定，采用短信方式送达时，送达人员应记录收发手机号码、发送时间、送达诉讼文书名称，并将短信送达内容拍摄照片存卷备查。如果原告无法提供这些证明，那么其主张的短信通知的有效性将受到质疑。

三、查询运营商记录

在必要时，被告还可以联系自己的手机运营商，查询在原告声称的发送短信的时间段内，是否有来自原告手机号码的短信记录。运营商的通讯记录通常具有法律效力，可以作为证明被告未收到短信的有力证据。

四、法庭上的陈述与辩解

如果案件进入诉讼程序，被告可以在法庭上陈述自己未收到短信通知的情况，并解释因此导致的相关后果。被告的陈述应当真实、客观，并尽可能提供其他证据来支持自己的主张。

五、申请法院调查取证

如果被告认为有必要，还可以向法院申请调查取证，请求法院协助查询原告是否确实发送了短信以及短信的发送情况。法院在审查后，如果认为有必要，可以依法进行调查取证。

综上所述，被告可以通过多种方式来证明自己未收到原告的短信通知。在采取任何行动之前，被告应当保持冷静、理性，并尽可能收集相关证据来支持自己的主张。同时，被告也应当了解自己的合法权益和诉讼程序的相关规定，以便在必要时采取适当的法律措施来维护自己的权益。