分居两年的时间并不是从起诉开始算。分居时间的计算方式通常是从夫妻双方最后一次共同生活，并且双方都有分居意愿的那一天起开始计算，到提起离婚诉讼时满两年为止。这里的分居必须是因感情不和而分居，且分居期间双方互不履行夫妻义务。

在具体操作中，要注意以下几点：

1. 分居的起算点：分居的起算点是从夫妻实际开始分居生活的时间，即双方明确表示不想再一起生活，并且开始分开居住的那一天。这一时间点需要双方共同认可，并且有明确的证据表明。

2. 分居的连续性：分居时间应连续计算。如果分居后又同居，应从同居后又分居的时间重新计算，前面的分居时间终止。即分居的时间应当连续计算，不应把前后几次分居的时间累计计算。

3. 分居的证据：在司法实践中，要想让法院认定分居两年这个事实，需要有足够充分的证据来支撑。这些证据可以包括双方签订的分居协议、证人证言（如邻居、朋友等可以证明夫妻双方确实是分开居住的）、一方在外租房的租赁合同等。这些证据能够形成完整的证据链，证明分居的起始和持续时长。

4. 起诉与分居时间的关系：起诉只是启动离婚程序的行为，并不会改变分居时间的起始点。因此，即使提起了离婚诉讼，分居时间的计算仍然是从夫妻双方最后一次共同生活并分开居住的那一天开始。

综上所述，分居两年的计算并不是从起诉开始算，而是从夫妻双方最后一次共同生活并分开居住的那一天起开始计算。在离婚诉讼中，分居时间是一个重要的考量因素，但要想让法院认定分居两年这个事实，必须有足够充分的证据来支撑。