公司正在被起诉时，一般情况下是可以办理注销的，但需视具体情况而定，且需谨慎处理。以下是详细分析：

1. 若起诉尚未进入实质性审理阶段：

   • 在这种情况下，如果公司能够妥善处理好相关诉讼事宜，并且符合注销的法定条件，那么是可以进行注销的。例如，公司已与原告达成和解协议，解决了纠纷，此时注销通常不会面临太大的法律风险。

2. 若起诉已进入审理程序，尤其是关键阶段：

   • 如正在进行庭审或等待判决结果，此时注销公司可能会面临较大的法律风险。法院可能会对注销行为提出异议，要求公司在诉讼处理完毕后再进行注销。因此，在这种情况下，建议公司谨慎考虑注销事宜，以免引发不必要的法律纠纷。

3. 考虑债权人的利益：

   • 公司在注销过程中，必须依法进行清算，清偿债务。如果公司在注销时有未清偿的债务，债权人可能会对注销行为提出异议，要求公司承担相应责任。因此，公司在注销前需要确保所有债务都已得到妥善处理。

综上所述，公司在被起诉期间办理注销需要谨慎处理，确保诉讼问题得到妥善解决，同时保障债权人的合法权益。如果公司在注销过程中存在任何违法行为或未依法履行通知、公告等程序，都可能面临潜在的法律责任。因此，建议公司在被起诉期间咨询专业律师的意见，以确保注销行为的合法性和安全性。如果您有任何关于公司注销的法律问题，可以直接向我咨询。