淘宝网店企业以自然人名义注册是不合法的。具体来说：

1. 注册主体要求：

   • 根据相关法律法规，淘宝网店作为企业的经营行为，应当以其真实的企业身份进行注册，而不是以自然人的名义。这是因为企业的经营活动涉及到更多的法律责任和义务，需要以企业的名义来承担。

2. 合规经营：

   • 以企业名义注册淘宝网店，有助于确保经营活动的合规性。企业需要按照相关法律法规的要求，进行税务登记、工商年报等，这些都需要以企业的名义进行。
   • 如果以自然人名义注册，可能会规避掉一些本应由企业承担的法律责任，这不仅违反了法律法规，也不利于市场的公平竞争。

3. 消费者权益保护：

   • 以企业名义注册，有助于更好地保护消费者的权益。企业在经营过程中，需要遵守消费者权益保护法等相关法律法规，确保消费者的合法权益不受侵害。
   • 如果以自然人名义注册，一旦发生消费纠纷，消费者可能面临更大的维权难度。

4. 平台规定：

   • 淘宝等平台也有相应的规定，要求商家以真实的身份信息进行注册。如果以自然人名义注册企业店铺，可能会违反平台的规定，导致店铺被封禁或面临其他处罚。

综上所述，淘宝网店企业应以企业名义进行注册，以确保经营活动的合法性、合规性和消费者权益的保护。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。