卖假药被法院判刑罚款后，市场监督部门仍有可能进行罚款。

首先，我们需要明确的是，法院判刑罚款和市场监督部门的罚款是两种不同性质的处罚。法院判刑罚款是刑事处罚或者刑事附带民事处罚的一部分，是对犯罪行为或者犯罪行为造成的损害进行的惩罚和赔偿。而市场监督部门的罚款则是行政处罚，是对违反市场监督管理法律法规的行为进行的惩罚。

在卖假药的情况下，如果行为已经构成了犯罪，那么法院会依法进行审判，并作出相应的刑事处罚，包括判刑和罚款等。但这并不意味着市场监督部门就不能再进行处罚了。因为市场监督部门有其独立的执法权力和职责，他们会对违反市场监督管理法律法规的行为进行查处，并依法作出行政处罚，包括罚款等。

因此，即使卖假药的行为已经被法院判刑罚款了，但如果该行为同时违反了市场监督管理法律法规，那么市场监督部门仍然有权进行罚款等行政处罚。

总的来说，法院判刑罚款和市场监督部门的罚款是两种不同性质的处罚，它们并不互相排斥。在卖假药的情况下，如果行为同时触犯了刑法和市场监督管理法律法规，那么行为人可能会面临双重处罚。