工程款当高利贷不合法。

首先，工程款是基于建设工程合同而产生的款项，其性质属于合同之债，应当按照合同约定的方式和期限进行支付。而高利贷则是指利率高于法定利率的贷款，其本质是一种借贷行为，受到严格的法律监管。

将工程款当作高利贷来处理，存在以下几个方面的违法性：

1. 违反合同约定：工程款是按照建设工程合同约定的方式和期限支付的，如果将其当作高利贷来处理，就违反了合同的约定，构成违约行为。

2. 违反利率规定：高利贷的利率通常高于法定利率，如果将工程款当作高利贷来处理，就可能涉及违反国家关于利率的法律规定，构成非法金融活动。

3. 损害社会公共利益：高利贷往往伴随着高风险和高利润，容易引发社会矛盾和纠纷。将工程款当作高利贷来处理，不仅可能损害工程承包人和施工人的合法权益，还可能对社会公共利益造成损害。

因此，工程款不能当作高利贷来处理。如果在实际操作中遇到类似问题，应当及时咨询专业律师，依法维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。