中介借5万到手4万，这种情况的合法性取决于具体的合同约定和相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同约定情况：

   • 如果在借款合同或中介服务合同中明确约定了中介费、服务费等费用，并且这些费用的扣除导致了实际到账金额少于借款金额，那么只要这种约定不违反法律法规的强制性规定，就是合法的。
   • 例如，合同中可能规定中介费为借款金额的20%，那么借款5万时，到账金额就是4万，这种情况是合法的。

2. 无合同约定或违法约定情况：

   • 如果合同中没有相关费用的约定，或者约定的费用超出了法律法规允许的范围（如高利贷、不合理费用等），那么中介擅自扣除款项导致到账金额与借款金额不符，就可能构成违法违规行为。
   • 在这种情况下，借款人有权要求中介按照合同约定足额发放借款，并对不合理的扣款行为进行纠正。如果中介拒绝纠正，借款人可以通过法律途径维护自己的合法权益。

3. 法律建议：

   • 在签订借款合同或中介服务合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于费用扣除、利息计算等方面的内容。
   • 如果对合同条款有疑问或不明确的地方，应及时咨询专业律师或相关机构进行解答。
   • 如果发现中介存在违法违规行为，应及时向相关部门举报并寻求法律帮助。

综上所述，中介借5万到手4万的合法性取决于具体的合同约定和相关法律法规。在签订合同时应谨慎阅读条款，并在有疑问时及时咨询专业律师。如果中介存在违法违规行为，应依法维护自己的合法权益。