在项目申报过程中，如果乙方违约，处理方式主要依据合同的具体条款以及违约的严重程度。以下是我作为律师，结合多领域法律实务经验，为你提供的详细建议：

1. 首先审查合同条款：

   • 仔细查阅项目申报合同，特别是关于违约责任、违约救济、合同解除等条款。
   • 确认乙方违约的具体行为是否构成合同约定的违约情形。

2. 评估违约影响：

   • 分析乙方违约对项目申报的进度、成本、质量等方面可能产生的影响。
   • 判断违约行为是否属于根本性违约，即是否导致合同目的无法实现。

3. 与乙方沟通协商：

   • 在确认违约后，首先尝试与乙方进行友好沟通，了解违约原因，探讨是否有可能通过协商达成解决方案。
   • 可以提出要求乙方采取补救措施、赔偿损失等合理要求。

4. 依据合同条款采取法律行动：

   • 如果沟通协商无果，或者乙方拒绝承担责任，你可以根据合同条款采取相应的法律行动。
   • 例如，如果合同中有关于违约金的约定，你可以要求乙方支付违约金；如果合同中有解除条款，且乙方违约行为构成根本性违约，你可以考虑解除合同并要求乙方赔偿损失。

5. 保留证据，备查备用：

   • 在整个处理过程中，务必保留好所有与乙方违约相关的证据，包括合同文本、沟通记录、违约行为证明等。
   • 这些证据将在未来的法律纠纷中起到至关重要的作用。

6. 考虑聘请专业律师介入：

   • 如果违约情况复杂，或者涉及较大的经济利益，你可以考虑聘请专业律师介入处理。
   • 律师将能够为你提供更专业的法律建议，帮助你更好地维护自身权益。

综上所述，处理项目申报乙方违约的问题需要综合考虑多个方面，包括合同条款、违约影响、沟通协商以及法律行动等。如果你在这个过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。