职工债权涉税问题处理流程主要涉及到企业破产或重整过程中的税务处理。以下是一个详细、清晰的流程说明：

一、初步准备与税务信息查询

1. 指定管理人：人民法院裁定受理企业破产申请后，会指定管理人。管理人需持人民法院出具的指定管理人决定书，代表破产企业至主管税务机关办理相关涉税事宜。

2. 税务信息查询：管理人可通过电子税务局、办税服务厅等途径查询破产企业的纳税申报、税费缴纳和接受处罚等税务信息。查询时需提供指定管理人决定书、有效身份证件等必要文件。

二、纳税申报与补办

1. 补办纳税申报：管理人需据实补办人民法院裁定受理破产申请前企业未办理的纳税申报。若未发现债务人有应税行为，可暂按零申报补办纳税申报。

2. 后续纳税申报：人民法院裁定受理企业破产申请后，因继续营业或破产财产的使用、拍卖、变现所产生的税费，管理人需代表破产企业按规定申报纳税。

三、解除非正常户与发票管理

1. 解除非正常户：若企业在破产申请前被认定为非正常户，管理人需接受处罚并补办纳税申报，主管税务机关将解除企业的非正常户认定。

2. 发票管理：管理人需妥善管理和使用发票，包括使用破产企业的原有发票或按规定申领、代开发票。

四、税务处理与处罚

1. 税务处理：对于破产前的税费违法行为，主管税务机关将依法作出行政处理、处罚决定，并将相关税费及罚款进行债权申报。

2. 税控设备与发票丢失处理：若税控设备、发票在接管前丢失，管理人需及时向主管税务机关报备，并按规定进行挂失、补办等。

五、税收优惠与重整税务处理

1. 税收优惠：依法进入破产程序的企业，若确有困难，可按规定向主管税务机关申请房产税和城镇土地使用税困难减免。

2. 税务信息变更与纳税信用修复：重整过程中需办理税务登记信息变更的，税务机关将主动接收市场监督管理部门变更信息。同时，管理人可向主管税务机关提出纳税信用修复申请。

六、清算期间企业所得税处理

企业终止经营活动后，需进行企业清算所得税处理。包括预缴企业所得税、办理当期企业所得税汇算清缴，并以整个清算期作为一个独立的纳税年度计算清算所得。

七、税费债权申报与入库

1. 税费债权申报：管理人需书面通知税务机关申报税费债权，税务机关将依法清查并申报企业所欠税费、滞纳金、罚款等。

2. 税费入库：在破产企业财产分配时，管理人需持人民法院关于财产分配的裁定书到主管税务机关办理税费入库手续。

八、税务注销

企业经人民法院裁定宣告破产的，管理人可持人民法院终结破产程序裁定书向税务机关申请企业税务注销。税务机关将按照相关规定出具清税文书，核销“死欠”。

九、其他注意事项

• 税务机关在破产程序中一般不再启动税务检查程序，但发现重大违法线索必须查处。
• 管理人需遵守税费法律、法规，否则主管税务机关将责令限期整改，并可能通报人民法院。

综上所述，职工债权涉税问题处理流程涉及多个环节和步骤，需要管理人、税务机关和相关部门密切配合，确保税收债权依法清收，同时降低市场主体退出成本，优化营商环境。