当公司遇到合同纠纷转变为合同诈骗的情况时，需要采取一系列积极且有序的措施来维护自身的合法权益。以下是一些具体的建议：

一、立即收集并保留证据

1. 合同文本：确保拥有完整的合同原件或复印件，这是证明双方合同关系的基础。
2. 往来邮件和聊天记录：保存所有与对方沟通的记录，包括邮件、短信、即时通讯软件聊天记录等，这些可以作为对方行为意图和欺诈行为的证据。
3. 付款凭证：收集所有与合同相关的付款记录，如银行转账凭证、收据等，以证明资金往来情况。
4. 其他相关证据：如录音、视频、证人证言等，任何能够证明对方欺诈行为的证据都应予以保留。

二、及时向公安机关报案

1. 准备报案材料：整理一份详细的报案材料，包括案件的基本情况、双方信息、合同内容、欺诈行为的具体描述以及上述收集到的所有证据。
2. 前往公安机关：携带报案材料前往当地公安机关的经侦部门报案，详细陈述案件经过，并提交相关证据。
3. 配合调查：报案后，应积极配合公安机关的调查工作，提供必要的协助和信息。

三、考虑采取法律手段

1. 民事诉讼：在刑事诉讼之外，还可以考虑向法院提起民事诉讼，要求对方返还财产、赔偿损失等。准备好起诉状、证据材料等，向有管辖权的法院提起诉讼。
2. 财产保全：为防止对方转移财产逃避法律责任，可以向法院申请财产保全，冻结对方的相关资产。
3. 刑事附带民事诉讼：如果对方被刑事立案，可以在刑事诉讼中提起附带民事诉讼，要求赔偿经济损失。

四、保持冷静并避免进一步损失

1. 保持冷静：面对合同纠纷转变为合同诈骗的情况，首先要保持冷静，不要惊慌失措。
2. 避免进一步经济往来：在处理过程中，应避免与对方发生进一步的经济往来，以免陷入更多的麻烦。
3. 关注案件进展：在等待公安机关和法院处理结果的过程中，要密切关注案件进展，及时了解相关情况。

综上所述，当公司遇到合同纠纷转变为合同诈骗时，应立即采取行动，收集证据、报案、考虑采取法律手段，并保持冷静避免进一步损失。通过积极有效的措施，可以最大程度地维护公司的合法权益。