毕业生就业协议不签确实可能会影响档案的转递。虽然从2023年起，国家取消了就业报到证，并不再将就业报到证作为流动人员人事档案的必需材料，但毕业生的毕业去向登记和确认仍然是离校手续中的一个必要环节。这一环节直接关系到毕业生的后续签约、转档和落户。

具体来说，如果毕业生没有签订就业协议，那么在进行毕业去向登记时，就需要特别注明这一情况。而毕业生的档案转递是根据毕业去向登记信息来进行的。如果毕业去向不明确或者没有登记，那么档案的转递就可能会受到影响，甚至可能出现档案无法及时转递到指定单位或机构的情况。

因此，建议毕业生在离校前务必完成毕业去向的登记和确认，即使暂时没有签订就业协议，也应该在登记时注明自己的具体去向，以便学校能够准确地将档案转递到相应的单位或机构。同时，毕业生也应该密切关注自己的档案转递情况，确保档案能够顺利、及时地到达指定地点。

总的来说，虽然不签就业协议不会直接导致档案无法转递，但可能会影响档案的转递效率和准确性。因此，毕业生在离校前应该妥善处理好自己的毕业去向登记和档案转递事宜。