首先，我们来明确一下问题的核心：股东将原本应作为工资的资金转为借款借给公司，这样的债务应如何处理。

1. 法律关系的界定：

   • 股东将工资转为借款，实际上是在公司与股东之间形成了一种债权债务关系。这种关系的法律性质是借款，而非工资支付。
   • 因此，公司需要按照借款协议的约定，向股东偿还本金及利息（如果协议中有约定利息的话）。

2. 债务处理的方式：

   • 按期偿还：如果公司财务状况良好，应按照借款协议约定的期限和方式，向股东偿还借款本金及利息。
   • 协商延期或分期偿还：如果公司暂时无法按期偿还，可以与股东协商延期偿还或分期偿还的安排。这需要双方达成一致，并可能需要签订补充协议来明确新的偿还条件。
   • 债务重组：在更复杂的情况下，如果公司面临严重的财务困难，可能需要与股东进行债务重组的谈判，这可能包括减免部分债务、转换债务为股权等其他形式的安排。

3. 法律风险的防范：

   • 明确协议条款：借款协议应明确借款金额、利率、偿还期限、违约责任等关键条款，以减少未来可能出现的法律纠纷。
   • 合规操作：公司应确保整个借款过程符合相关法律法规的要求，比如避免违反公司法的相关规定，确保借款行为不会损害公司其他股东或债权人的利益。
   • 财务记录：公司应准确记录这笔借款的入账和偿还情况，以确保财务记录的准确性和透明度。

4. 税务处理：

   • 股东将工资转为借款，可能会涉及到税务方面的问题。例如，如果借款未约定利息，那么股东可能无法就这部分资金获得利息收入所得税的减免。
   • 公司和股东都应咨询专业的税务顾问，以确保税务处理的合规性和最优化。

综上所述，股东将工资转为借款借给公司后，公司应按照借款协议的约定偿还债务。如果偿还存在困难，可以与股东协商延期或分期偿还的安排。在整个过程中，应确保操作的合规性，并咨询专业的税务顾问以处理相关税务问题。如果您有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。