个税汇算清缴的扣款主要是通过以下几个途径进行的：

1. 银行账户扣款：一般情况下，个税汇算清缴的应补税款，税务部门会从您绑定的银行账户中直接扣款。因此，您需要确保绑定的银行账户中有足够的资金以支付税款。

2. 第三方支付扣款：除了银行账户，有些地区也支持通过第三方支付平台进行税款的缴纳，例如支付宝、微信支付等。这通常需要您在税务部门的官方网站或平台上进行操作。

3. 到税务局现场缴款：如果您选择到税务局现场进行汇算清缴，您可以直接在税务局的窗口进行现金或银行卡的支付。

请注意，具体的扣款方式和操作步骤可能会因地区和政策的不同而有所差异。为了确保您的个税汇算清缴顺利进行，建议您提前了解并咨询当地税务局的相关规定和操作流程。如果有任何疑问或困难，您可以直接向我提问，我会尽力为您提供帮助。