针对“个税系统工资与计提工资不一致怎么办”的问题，以下是一些可能的解决方案和建议：

首先，当发现个税系统工资与计提工资不一致时，应首先确认差异的具体原因。可能的原因包括数据录入错误、计算方法差异、时间差异、政策变更导致的计算方式调整，或是人为故意造成的错误。了解原因后，可以针对性地采取措施。

如果是由于数据录入错误导致的差异，需要对工资表和个税系统中的数据进行逐项核对，找出并修正错误。如果是计算方法或政策变更导致的差异，需要根据最新的个人所得税法律法规，调整工资表的计算方法，以确保与个税系统一致。

在处理这种差异时，一般应以个税系统的数据为准。如果可以直接调整工资表，那么直接调整工资表实际发放金额即可。如果无法调整当期工资表，且工资表个税多于个税系统，那么在实际扣除个税时会产生余额，这个余额应归属员工，可以通过适当的会计处理进行转出。反之，如果个税系统个税多于工资表个税，那么需要处理帮助员工多交的个税，可以在下期从职工的工资内再扣回来。

此外，为了避免这种情况的再次发生，可以采取一些预防措施。例如，建立定期核对机制，每月或每季度进行数据比对；优化信息系统，引入专业的薪酬管理系统和税务申报系统，实现数据的自动传输和比对；加强内部沟通与协作，确保财务部门、人力资源部门等之间的数据一致性和完整性。

总的来说，个税系统与工资表不符合可能带来税务风险和财务核算问题，因此需要及时分析原因并采取相应措施确保数据一致性，以遵守税法规定并避免潜在的法律风险。