在离婚案件中，关于三周岁孩子的抚养权归属问题，这确实是一个需要细致考虑和多方面权衡的复杂问题。法院在做出判决时，首要的原则是确保孩子的最佳利益，也就是遵循“孩子利益最大化”的原则。

首先，值得注意的是，三周岁的孩子通常更倾向于判给母亲，因为在这个阶段，孩子更需要母亲的照顾和陪伴，这有助于他们的情感和心理发展。然而，这并不是一个绝对的规则，法院会综合考虑父母双方的抚养条件，包括经济状况、居住环境、教育背景等。

如果父亲能够证明自己具备更优的抚养条件，例如有足够的时间陪伴孩子，能够提供更好的教育资源和生活环境，那么他也有可能获得抚养权。此外，法院还会考虑父母双方的抚养意愿和态度，以及孩子对父母的依赖程度等因素。

除了上述因素外，还有一些特殊情形可能会影响抚养权的判决。例如，如果一方患有严重疾病或有不良嗜好，这可能会对他们争取抚养权产生不利影响。另外，如果一方无其他子女而另一方有，前者在争取抚养权时可能会得到优先考虑。

总的来说，离婚时三周岁孩子的抚养权归属是一个需要综合考虑多方面因素的复杂问题。在这个过程中，父母双方都应该积极配合法院的调查和审理工作，同时寻求专业的法律支持，以确保孩子的最佳利益得到最大程度的保障。同时，父母双方也应该尽量通过协商和沟通来解决抚养权问题，以减少对孩子的伤害和不确定性。